TCGA (The Cancer Genome Atlas) — NIH가 주도한 11,000명+ 암 환자 게놈 프로젝트. 33개 암 종류의 mutation/임상 데이터 공개.
본 페이지의 데이터:
▸ SKCM (흑색종) — 438명, UV로 인한 폭발적 TMB (mutation 458개/환자 평균)
▸ PAAD (췌장암) — 174명, KRAS 67% 보유
▸ GBM (교모세포종) — 386명, 예후 가장 나쁜 뇌암
▸ LUAD (폐선암) — 561명, EGFR/KRAS driver
▸ BRCA (유방암) — 1,009명, PIK3CA 34%
용어 설명:
• Driver mutation (드라이버 변이) — 암 유발의 핵심 변이 (KRAS, BRAF, TP53 등)
• % 환자 — 그 암 환자 중 이 유전자에 mutation이 있는 비율
• Top mutated genes — 환자 다수가 가진 변이 = Rebeauty 백신 우선 타겟
탭 클릭으로 암 종류 전환. Gene 검색창에서 BRCA1, KRAS 등 검색 가능.
본 페이지의 데이터:
▸ SKCM (흑색종) — 438명, UV로 인한 폭발적 TMB (mutation 458개/환자 평균)
▸ PAAD (췌장암) — 174명, KRAS 67% 보유
▸ GBM (교모세포종) — 386명, 예후 가장 나쁜 뇌암
▸ LUAD (폐선암) — 561명, EGFR/KRAS driver
▸ BRCA (유방암) — 1,009명, PIK3CA 34%
용어 설명:
• Driver mutation (드라이버 변이) — 암 유발의 핵심 변이 (KRAS, BRAF, TP53 등)
• % 환자 — 그 암 환자 중 이 유전자에 mutation이 있는 비율
• Top mutated genes — 환자 다수가 가진 변이 = Rebeauty 백신 우선 타겟
탭 클릭으로 암 종류 전환. Gene 검색창에서 BRCA1, KRAS 등 검색 가능.
TCGA (The Cancer Genome Atlas)? 환자 mutation 탐색
5개 암 종류 × 2,568명 × top 50 Driver Mutation? genes (출처: cBioPortal?)
선택된 암 (TCGA (The Cancer Genome Atlas)?)
PAAD
총 환자 수
174
표시된 genes?
50
PAAD Top mutated genes?
| Rank | Gene? | 환자 수 | % 환자 | 시각화 | 액션 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | KRAS | 117 | 67.2% |
|
구조 보기 |
| 2 | TP53 | 107 | 61.5% |
|
구조 보기 |
| 3 | SMAD4 | 37 | 21.3% |
|
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| 4 | CDKN2A | 35 | 20.1% |
|
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| 5 | TTN | 29 | 16.7% |
|
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| 6 | MUC16 | 13 | 7.5% |
|
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| 7 | RNF43 | 11 | 6.3% |
|
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| 8 | CSMD2 | 10 | 5.8% |
|
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| 9 | RYR1 | 10 | 5.8% |
|
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| 10 | ARID1A | 9 | 5.2% |
|
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| 11 | PCDH15 | 9 | 5.2% |
|
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| 12 | OBSCN | 8 | 4.6% |
|
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| 13 | FLG | 8 | 4.6% |
|
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| 14 | ATM | 8 | 4.6% |
|
구조 보기 |
| 15 | HECW2 | 8 | 4.6% |
|
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| 16 | RNF213 | 8 | 4.6% |
|
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| 17 | MYO18B | 8 | 4.6% |
|
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| 18 | CACNA1B | 8 | 4.6% |
|
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| 19 | TGFBR2 | 8 | 4.6% |
|
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| 20 | RELN | 7 | 4.0% |
|
구조 보기 |
| 21 | RREB1 | 7 | 4.0% |
|
구조 보기 |
| 22 | KMT2D | 7 | 4.0% |
|
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| 23 | COL6A2 | 7 | 4.0% |
|
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| 24 | GLI3 | 7 | 4.0% |
|
구조 보기 |
| 25 | USH2A | 7 | 4.0% |
|
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| 26 | GNAS | 7 | 4.0% |
|
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| 27 | DSCAML1 | 7 | 4.0% |
|
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| 28 | KMT2C | 7 | 4.0% |
|
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| 29 | DNAH11 | 7 | 4.0% |
|
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| 30 | FLNC | 7 | 4.0% |
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| 31 | SCN5A | 7 | 4.0% |
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| 32 | MAP3K21 | 7 | 4.0% |
|
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| 33 | KDM6A | 7 | 4.0% |
|
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| 34 | PCDHB7 | 7 | 4.0% |
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| 35 | APBA2 | 7 | 4.0% |
|
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| 36 | FAT3 | 7 | 4.0% |
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| 37 | LRP1B | 7 | 4.0% |
|
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| 38 | FAT2 | 7 | 4.0% |
|
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| 39 | ADAMTS12 | 7 | 4.0% |
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| 40 | ABTB3 | 6 | 3.5% |
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| 41 | PEG3 | 6 | 3.5% |
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| 42 | KCNA6 | 6 | 3.5% |
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| 43 | NOS1 | 6 | 3.5% |
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| 44 | TPO | 6 | 3.5% |
|
구조 보기 |
| 45 | APOB | 6 | 3.5% |
|
구조 보기 |
| 46 | ZFHX4 | 6 | 3.5% |
|
구조 보기 |
| 47 | SYNE1 | 6 | 3.5% |
|
구조 보기 |
| 48 | ADAMTS16 | 6 | 3.5% |
|
구조 보기 |
| 49 | PCDH9 | 6 | 3.5% |
|
구조 보기 |
| 50 | MUC17 | 6 | 3.5% |
|
구조 보기 |
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