AlphaFold 구조 뷰어
35개 NeoVax 핵심 단백질 (AlphaFold DB v6) — 인터랙티브 3D + 초보자 가이드
1️⃣ 색깔 = pLDDT (AI의 자신감 점수, 0~100)
파란색 (90+): 매우 자신 있음 — 거의 확실한 구조
청록색 (70~90): 신뢰할 수 있음
노란색 (50~70): 보통 — 주의해서 해석
주황/빨간색 (50 미만): 신뢰 낮음 — 유연한 영역(loop)일 가능성
2️⃣ 모양 = 단백질 2차 구조
🌀 나선 (α-helix)
코일형 — 단백질의 안정적인 골격. 약 30% 차지.
📜 시트 (β-sheet)
평평한 화살표 — DNA·리간드 결합에 자주 사용.
〰️ 루프 (loop)
유연한 영역 — pLDDT 낮을 수 있음. Active site에 자주 위치.
3️⃣ 변이 위치 = NeoVax 신생항원 적합도 결정
🟢 표면 노출 (RSA > 30%) — 면역세포가 인식 가능 → NeoVax 백신 후보 ✓
🟡 부분 노출 (RSA 10~30%) — 일부 인식 가능, 추가 검증 필요
🔴 묻힘 (RSA < 10%) — 단백질 내부 → NeoVax 백신 부적합 ✗
→ 같은 driver mutation이라도 위치에 따라 백신 효과가 완전히 다름
4️⃣ 조작법 (마우스/터치)
🖱️ 드래그: 회전
🔄 휠: 줌 인/아웃
⌨️ Shift+드래그: 이동
🎯 버튼: 스타일 변경
💡 처음이라면 이 순서로 보세요
- 전체 모양 보기 (나선/시트/루프 비율 확인)
- 색깔 보기 (파란색 영역 = 핵심 기능부)
- 변이 잔기 번호 입력 → 위치 강조
- 표면(Surface) 모드로 전환해서 변이가 표면에 있는지 확인
- 아래 "변이 임상 컨텍스트"로 의학적 의미 읽기
⚡ 변이 빠른 선택 (클릭 → 자동 강조)
단백질 (35)
🦠 Cancer Drivers?
ATRX
2492aa
BRAF
766aa
BRCA1
1863aa
CDH1
882aa
CDKN2A
156aa
CTNNB1
781aa
EGFR
1210aa
GATA3
443aa
H3-3A
136aa
HRAS
189aa
IDH1
414aa
IDH2
452aa
KIT
976aa
KRAS
189aa
MET
1390aa
MYC
454aa
NF1
593aa
NRAS
189aa
PIK3CA
1068aa
PTEN
403aa
RB1
928aa
SMAD4
552aa
TERT
1132aa
TP53
393aa
VHL
213aa
💊 Drug Metabolism?
ACTN3
901aa
ALDH2
517aa
APOE
317aa
CYP1A2
516aa
CYP2C19
490aa
LCT
1927aa
VKORC1
163aa
🛡️ Immune (HLA (Human Leukocyte Antigen)?)
CTLA4
223aa
PD-1
288aa
PD-L1
290aa
BRAF
UniProt?: P15056 ·
766 아미노산 ·
478 KB
평균 pLDDT? (AI 자신감)
66.4 / 100
보통
📊 색상 = AI 자신감
매우 신뢰 (90+)
보통 (50~70)
낮음 (<50)
표시 모드:
📊 변이 위치 RSA (Relative Solvent Accessibility)? 분석
RSA (Relative Solvent Accessibility)? (Relative Solvent Accessibility) — 잔기가 표면에 얼마나 노출되어 있는지. NeoVax? 백신은 RSA (Relative Solvent Accessibility)? ≥ 30%인 변이만 후보로 선택.
잔기 번호를 입력하고 "🎯 위치 강조" 클릭
👉