TCGA (The Cancer Genome Atlas) — NIH가 주도한 11,000명+ 암 환자 게놈 프로젝트. 33개 암 종류의 mutation/임상 데이터 공개.
본 페이지의 데이터:
▸ SKCM (흑색종) — 438명, UV로 인한 폭발적 TMB (mutation 458개/환자 평균)
▸ PAAD (췌장암) — 174명, KRAS 67% 보유
▸ GBM (교모세포종) — 386명, 예후 가장 나쁜 뇌암
▸ LUAD (폐선암) — 561명, EGFR/KRAS driver
▸ BRCA (유방암) — 1,009명, PIK3CA 34%
용어 설명:
• Driver mutation (드라이버 변이) — 암 유발의 핵심 변이 (KRAS, BRAF, TP53 등)
• % 환자 — 그 암 환자 중 이 유전자에 mutation이 있는 비율
• Top mutated genes — 환자 다수가 가진 변이 = Rebeauty 백신 우선 타겟
탭 클릭으로 암 종류 전환. Gene 검색창에서 BRCA1, KRAS 등 검색 가능.
본 페이지의 데이터:
▸ SKCM (흑색종) — 438명, UV로 인한 폭발적 TMB (mutation 458개/환자 평균)
▸ PAAD (췌장암) — 174명, KRAS 67% 보유
▸ GBM (교모세포종) — 386명, 예후 가장 나쁜 뇌암
▸ LUAD (폐선암) — 561명, EGFR/KRAS driver
▸ BRCA (유방암) — 1,009명, PIK3CA 34%
용어 설명:
• Driver mutation (드라이버 변이) — 암 유발의 핵심 변이 (KRAS, BRAF, TP53 등)
• % 환자 — 그 암 환자 중 이 유전자에 mutation이 있는 비율
• Top mutated genes — 환자 다수가 가진 변이 = Rebeauty 백신 우선 타겟
탭 클릭으로 암 종류 전환. Gene 검색창에서 BRCA1, KRAS 등 검색 가능.
TCGA (The Cancer Genome Atlas)? 환자 mutation 탐색
5개 암 종류 × 2,568명 × top 50 Driver Mutation? genes (출처: cBioPortal?)
선택된 암 (TCGA (The Cancer Genome Atlas)?)
GBM
총 환자 수
386
표시된 genes?
50
GBM Top mutated genes?
| Rank | Gene? | 환자 수 | % 환자 | 시각화 | 액션 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | PTEN | 131 | 33.9% |
|
구조 보기 |
| 2 | TP53 | 121 | 31.4% |
|
구조 보기 |
| 3 | TTN | 100 | 25.9% |
|
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| 4 | EGFR | 91 | 23.6% |
|
구조 보기 |
| 5 | MUC16 | 58 | 15.0% |
|
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| 6 | FLG | 52 | 13.5% |
|
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| 7 | NF1 | 46 | 11.9% |
|
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| 8 | RYR2 | 42 | 10.9% |
|
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| 9 | PIK3R1 | 39 | 10.1% |
|
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| 10 | RB1 | 38 | 9.8% |
|
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| 11 | SPTA1 | 37 | 9.6% |
|
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| 12 | PIK3CA | 36 | 9.3% |
|
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| 13 | ATRX | 36 | 9.3% |
|
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| 14 | SYNE1 | 34 | 8.8% |
|
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| 15 | MUC17 | 29 | 7.5% |
|
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| 16 | LRP2 | 28 | 7.3% |
|
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| 17 | PCLO | 28 | 7.3% |
|
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| 18 | HMCN1 | 27 | 7.0% |
|
구조 보기 |
| 19 | OBSCN | 26 | 6.7% |
|
구조 보기 |
| 20 | PKHD1 | 26 | 6.7% |
|
구조 보기 |
| 21 | COL6A3 | 25 | 6.5% |
|
구조 보기 |
| 22 | IDH1 | 24 | 6.2% |
|
구조 보기 |
| 23 | DNAH5 | 24 | 6.2% |
|
구조 보기 |
| 24 | DNAH2 | 24 | 6.2% |
|
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| 25 | AHNAK2 | 24 | 6.2% |
|
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| 26 | USH2A | 22 | 5.7% |
|
구조 보기 |
| 27 | FLG2 | 22 | 5.7% |
|
구조 보기 |
| 28 | APOB | 21 | 5.4% |
|
구조 보기 |
| 29 | FAT2 | 21 | 5.4% |
|
구조 보기 |
| 30 | HRNR | 21 | 5.4% |
|
구조 보기 |
| 31 | LAMA1 | 21 | 5.4% |
|
구조 보기 |
| 32 | AHNAK | 20 | 5.2% |
|
구조 보기 |
| 33 | CFAP47 | 20 | 5.2% |
|
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| 34 | RELN | 20 | 5.2% |
|
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| 35 | HYDIN | 20 | 5.2% |
|
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| 36 | KEL | 19 | 4.9% |
|
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| 37 | KMT2C | 19 | 4.9% |
|
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| 38 | CNTNAP2 | 19 | 4.9% |
|
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| 39 | RIMS2 | 19 | 4.9% |
|
구조 보기 |
| 40 | RYR3 | 19 | 4.9% |
|
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| 41 | STAG2 | 18 | 4.7% |
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| 42 | TCHH | 18 | 4.7% |
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| 43 | SDK1 | 18 | 4.7% |
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| 44 | GALNT17 | 18 | 4.7% |
|
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| 45 | DNAH8 | 18 | 4.7% |
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| 46 | ADGRV1 | 18 | 4.7% |
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| 47 | DNAH11 | 18 | 4.7% |
|
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| 48 | DNAH9 | 18 | 4.7% |
|
구조 보기 |
| 49 | HSPG2 | 18 | 4.7% |
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| 50 | DNAH3 | 18 | 4.7% |
|
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