ClinVar 임상 비교
AlphaMissense AI 예측 vs ClinVar 실제 임상 분류 — 일치/불일치 분석
ClinVar 변이 (서브셋)
319,822
우리 보유 유전자만
커버 유전자
308
병원성/가능 변이
56,770
AM과 교차 가능
154,518
단백질 변이 추출
STXBP5L: AM vs ClinVar 일치도
155 변이✓ 둘 다 병원성
0
✓ 둘 다 양성
1
⚠ CV=병원성 / AM=양성
0
⚠ CV=양성 / AM=병원성
0
— AM 미적재
154
AM ↔ ClinVar 비교 가능 변이 1건 중 1건 일치 / 0건 불일치 — 일치도 100%
변이별 비교
Max 500| 변이 | ClinVar 분류 | AM 점수 | AM 분류 | 일치 | |
|---|---|---|---|---|---|
| A1015V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A1115T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A1115V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A334S | Uncertain significance | 0.102 | benign | 해석 → | |
| A40S | Uncertain significance | 0.076 | benign | 해석 → | |
| A43V | Uncertain significance | 0.101 | benign | 해석 → | |
| A625V | Uncertain significance | 0.425 | ambiguous | 해석 → | |
| A646G | Uncertain significance | 0.194 | benign | 해석 → | |
| A75T | Uncertain significance | 0.209 | benign | 해석 → | |
| A771G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A771V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A807T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| A968T | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| C1034S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C104S | Uncertain significance | 0.228 | benign | 해석 → | |
| C335S | Uncertain significance | 0.129 | benign | 해석 → | |
| C772F | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C969R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| D250H | Uncertain significance | 0.903 | pathogenic | 해석 → | |
| D332N | Uncertain significance | 0.592 | pathogenic | 해석 → | |
| D406G | Uncertain significance | 0.561 | ambiguous | 해석 → | |
| D565E | Uncertain significance | 0.163 | benign | 해석 → | |
| D750N | Uncertain significance | 0.651 | pathogenic | 해석 → | |
| D894E | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E229* | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| E445K | Uncertain significance | 0.339 | benign | 해석 → | |
| E52A | Uncertain significance | 0.963 | pathogenic | 해석 → | |
| F372C | Uncertain significance | 0.194 | benign | 해석 → | |
| F667C | Uncertain significance | 0.479 | ambiguous | 해석 → | |
| F875L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G1067R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G1103D | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| G1127R | Uncertain significance | 0.552 | ambiguous | 해석 → | |
| G21D | Uncertain significance | 0.310 | benign | 해석 → | |
| G29D | Uncertain significance | 0.252 | benign | 해석 → | |
| G30R | Uncertain significance | 0.325 | benign | 해석 → | |
| G758S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| H149Q | Uncertain significance | 0.945 | pathogenic | 해석 → | |
| H38Q | Uncertain significance | 0.089 | benign | 해석 → | |
| I200N | Uncertain significance | 0.998 | pathogenic | 해석 → | |
| I290V | Uncertain significance | 0.057 | benign | 해석 → | |
| I679T | Uncertain significance | 0.073 | benign | 해석 → | |
| I775V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| I800T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| I841S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| I84S | Uncertain significance | 0.973 | pathogenic | 해석 → | |
| I920T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| I956L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| I979T | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| K152R | Uncertain significance | 0.127 | benign | 해석 → | |
| K241N | Uncertain significance | 0.996 | pathogenic | 해석 → | |
| K241R | Uncertain significance | 0.101 | benign | 해석 → | |
| K301E | Uncertain significance | 0.619 | pathogenic | 해석 → | |
| K488Q | Uncertain significance | 0.930 | pathogenic | 해석 → | |
| K63R | Uncertain significance | 0.144 | benign | 해석 → | |
| K699E | Uncertain significance | 0.639 | pathogenic | 해석 → | |
| K820R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L148F | Uncertain significance | 0.945 | pathogenic | 해석 → | |
| L224Q | Uncertain significance | 0.994 | pathogenic | 해석 → | |
| L245V | Uncertain significance | 0.075 | benign | 해석 → | |
| L279V | Uncertain significance | 0.080 | benign | 해석 → | |
| L455P | Uncertain significance | 0.162 | benign | 해석 → | |
| L486V | Uncertain significance | 0.678 | pathogenic | 해석 → | |
| L627F | Uncertain significance | 0.573 | pathogenic | 해석 → | |
| L662F | Uncertain significance | 0.553 | ambiguous | 해석 → | |
| L708M | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L866F | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L868M | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L945P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| L984P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M1040I | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| M195L | Uncertain significance | 0.588 | pathogenic | 해석 → | |
| M343I | Uncertain significance | 0.763 | pathogenic | 해석 → | |
| M519I | Uncertain significance | 0.417 | ambiguous | 해석 → | |
| M619V | Uncertain significance | 0.242 | benign | 해석 → | |
| M814K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M980L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M982V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| M990V | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| N1011S | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| N278K | Uncertain significance | 0.916 | pathogenic | 해석 → | |
| N912H | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| N976K | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| P1095S | Likely benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| P218T | Uncertain significance | 0.978 | pathogenic | 해석 → | |
| P367T | Uncertain significance | 0.916 | pathogenic | 해석 → | |
| P39L | Uncertain significance | 0.093 | benign | 해석 → | |
| P423L | Uncertain significance | 0.200 | benign | 해석 → | |
| P423S | Uncertain significance | 0.143 | benign | 해석 → | |
| P461S | Uncertain significance | 0.287 | benign | 해석 → | |
| P571A | Uncertain significance | 0.062 | benign | 해석 → | |
| P576L | Uncertain significance | 0.075 | benign | 해석 → | |
| P578A | Uncertain significance | 0.074 | benign | 해석 → | |
| P712L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| Q166H | Uncertain significance | 0.775 | pathogenic | 해석 → | |
| Q458P | Uncertain significance | 0.133 | benign | 해석 → | |
| Q583R | Uncertain significance | 0.098 | benign | 해석 → | |
| Q624R | Uncertain significance | 0.661 | pathogenic | 해석 → | |
| R1114H | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R144T | Uncertain significance | 0.329 | benign | 해석 → | |
| R155Q | Uncertain significance | 0.856 | pathogenic | 해석 → | |
| R284H | Uncertain significance | 0.189 | benign | 해석 → | |
| R558Q | Uncertain significance | 0.133 | benign | 해석 → | |
| R618Q | Uncertain significance | 0.771 | pathogenic | 해석 → | |
| R683G | Uncertain significance | 0.090 | benign | 해석 → | |
| R693Q | Uncertain significance | 0.284 | benign | 해석 → | |
| R719H | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R756C | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R765Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R791H | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R791L | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R791P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R819Q | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| R880P | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| S130C | Uncertain significance | 0.050 | benign | 해석 → | |
| S295I | Uncertain significance | 0.056 | benign | 해석 → | |
| S606G | Uncertain significance | 0.080 | benign | 해석 → | |
| S796G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| S834G | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| S986N | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| T1133I | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| T179A | Uncertain significance | 0.376 | ambiguous | 해석 → | |
| T206S | Uncertain significance | 0.134 | benign | 해석 → | |
| T288I | Uncertain significance | 0.055 | benign | 해석 → | |
| T341A | Uncertain significance | 0.969 | pathogenic | 해석 → | |
| T362P | Uncertain significance | 0.116 | benign | 해석 → | |
| T366M | Uncertain significance | 0.237 | benign | 해석 → | |
| T594A | Uncertain significance | 0.063 | benign | 해석 → | |
| T596A | Uncertain significance | 0.073 | benign | 해석 → | |
| T780A | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| T854I | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| T89M | Uncertain significance | 0.366 | ambiguous | 해석 → | |
| V1019I | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| V379M | Conflicting classifications of pathogeni | 0.376 | ambiguous | 해석 → | |
| V37L | Uncertain significance | 0.087 | benign | 해석 → | |
| V389F | Uncertain significance | 0.672 | pathogenic | 해석 → | |
| V510A | Uncertain significance | 0.288 | benign | 해석 → | |
| V563I | Likely benign | 0.062 | benign | ✓ | 해석 → |
| V628F | Uncertain significance | 0.929 | pathogenic | 해석 → | |
| V628L | Uncertain significance | 0.606 | pathogenic | 해석 → | |
| V634I | Uncertain significance | 0.099 | benign | 해석 → | |
| V654I | Uncertain significance | 0.081 | benign | 해석 → | |
| V831I | Benign | — | 미적재 | 해석 → | |
| V857I | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| V910A | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| W138R | Uncertain significance | 1.000 | pathogenic | 해석 → | |
| W522L | Uncertain significance | 0.293 | benign | 해석 → | |
| W905R | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| Y561C | Uncertain significance | 0.057 | benign | 해석 → | |
| Y925C | Uncertain significance | — | 미적재 | 해석 → | |
| C828F | - | — | 미적재 | 해석 → | |
| D899G | - | — | 미적재 | 해석 → | |
| G191* | - | — | 미적재 | 해석 → | |
| G863S | - | — | 미적재 | 해석 → | |
| V612L | - | 0.771 | pathogenic | 해석 → |
AM 임계: 병원성 ≥ 0.564, 양성 < 0.34 (AlphaMissense 권장 컷오프, Cheng et al. Science 2023)
📚 데이터: NCBI ClinVar variant_summary (GRCh38, 최근 다운로드) + 우리 유전자 서브셋만 추출.