AlphaMissense 실데이터 연결됨 AlphaGenome API 연결됨 Gemini 연결됨
연동 안내 — 점수를 임의 생성하지 않습니다. 환경변수 ALPHAMISSENSE_DATA(TSV 경로) / ALPHAGENOME_API_KEY를 설정하면 실제 예측값이 자동 표시됩니다. 두 모델은 비상업 연구용 라이선스입니다.

AlphaMissense란

Overview
AlphaFold를 변이 빈도 데이터로 미세조정해 단백질 코딩 미스센스 변이(전체 게놈의 약 2%)의 병원성을 예측하는 모델입니다(Cheng et al., Science 2023). 변이를 양성 가능 / 불확실 / 병원성 가능으로 분류하며, ClinVar와 높은 일치를 보입니다. 최근에는 산전 진단(예: 초음파 이상 태아의 L1CAM 변이 병원성 신속 판정)에도 활용됩니다.
비코딩(98%) 조절 변이는 AlphaGenome(별도 아이템)이 담당합니다.

적재 현황 (실데이터)

Loaded
적재 변이
4,677,806
missense variants
유전자
314
genes
병원성
2,174,257
불확실
648,826
양성
1,854,723

변이 병원성 검색

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35개 유전자 미스센스 변이 (4,677,806개) 즉시 조회

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VKORC1 — 3,097개 변이 (점수 높은 순, 35/62p)
변이병원성 확률분류3D
F150A 0.4774 불확실 보기
M106P 0.4770 불확실 보기
A48I 0.4754 불확실 보기
K159F 0.4753 불확실 보기
W147Q 0.4753 불확실 보기
S109W 0.4742 불확실 보기
V118C 0.4737 불확실 보기
S50T 0.4722 불확실 보기
L27A 0.4712 불확실 보기
I86T 0.4712 불확실 보기
L111Y 0.4710 불확실 보기
V66G 0.4701 불확실 보기
T137F 0.4663 불확실 보기
A48H 0.4659 불확실 보기
D36Q 0.4654 불확실 보기
T138V 0.4642 불확실 보기
R33T 0.4639 불확실 보기
M146I 0.4636 불확실 보기
V69S 0.4631 불확실 보기
C85M 0.4631 불확실 보기
P8H 0.4626 불확실 보기
L107N 0.4623 불확실 보기
I75N 0.4623 불확실 보기
D38L 0.4614 불확실 보기
L27R 0.4613 불확실 보기
W5M 0.4612 불확실 보기
R33E 0.4608 불확실 보기
S144N 0.4603 불확실 보기
M106N 0.4603 불확실 보기
R53G 0.4600 불확실 보기
D36T 0.4597 불확실 보기
V127G 0.4589 불확실 보기
L13E 0.4587 불확실 보기
K152F 0.4582 불확실 보기
V11C 0.4579 불확실 보기
R37F 0.4577 불확실 보기
L114W 0.4572 불확실 보기
T47W 0.4571 불확실 보기
L97N 0.4564 불확실 보기
W147H 0.4559 불확실 보기
R53T 0.4553 불확실 보기
C16S 0.4550 불확실 보기
L90C 0.4548 불확실 보기
A121L 0.4539 불확실 보기
S50A 0.4528 불확실 보기
L92A 0.4523 불확실 보기
R33V 0.4523 불확실 보기
R35F 0.4523 불확실 보기
G116T 0.4518 불확실 보기
L148K 0.4517 불확실 보기

드라이버 변이 병원성

Variants
유전자변이 AlphaMissense병원성 확률 출처TCGA 빈도3D 구조
BRAF V600E 병원성 가능 0.993 AlphaMissense 실데이터 SKCM 53% 보기
KRAS G12D 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12C 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
NRAS Q61K 병원성 가능 0.985 AlphaMissense 실데이터 SKCM 29% 보기
HRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기
TP53 R175H 병원성 가능 0.986 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
TP53 R248Q 병원성 가능 0.996 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
EGFR L858R 병원성 가능 0.997 AlphaMissense 실데이터 GBM 24% 보기
PIK3CA H1047R 불확실 0.538 AlphaMissense 실데이터 BRCA 34% 보기
IDH1 R132H 병원성 가능 0.992 AlphaMissense 실데이터 GBM 6% 보기
IDH2 R172K 병원성 가능 0.994 AlphaMissense 실데이터 - 보기
KIT D816V 병원성 가능 0.999 AlphaMissense 실데이터 - 보기
CTNNB1 S37F 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기

병원성 확률(0~1)은 실데이터 연동 시에만 표시됩니다. 현재 분류는 임상적으로 확립된 드라이버 기준(예시)이며 AlphaMissense도 동일하게 병원성으로 분류합니다.

산전 진단 연계

Prenatal
AlphaMissense는 초음파 이상 태아에서 발견된 미스센스 변이(예: L1CAM)의 병원성을 신속 판정해 산전 진단 워크플로를 가속한 사례가 보고되었습니다. 양수·융모막 확진검사 · 게놈 산전 종합 리포트와 연계됩니다.

실데이터 연동 방법

Setup
1. AlphaMissense 점수(비상업 연구용)를 받아 우리 유전자 서브셋 TSV로 변환:
gene  protein_variant  am_pathogenicity  am_class (탭 구분)
2. 환경변수 지정: ALPHAMISSENSE_DATA=/path/to/alphamissense_subset.tsv
3. 새로고침하면 위 표의 병원성 확률이 실제 값으로 자동 대체되고 출처가 "AlphaMissense 실데이터"로 표시됩니다.