AlphaMissense 실데이터 연결됨 AlphaGenome API 연결됨 Gemini 연결됨
연동 안내 — 점수를 임의 생성하지 않습니다. 환경변수 ALPHAMISSENSE_DATA(TSV 경로) / ALPHAGENOME_API_KEY를 설정하면 실제 예측값이 자동 표시됩니다. 두 모델은 비상업 연구용 라이선스입니다.

AlphaMissense란

Overview
AlphaFold를 변이 빈도 데이터로 미세조정해 단백질 코딩 미스센스 변이(전체 게놈의 약 2%)의 병원성을 예측하는 모델입니다(Cheng et al., Science 2023). 변이를 양성 가능 / 불확실 / 병원성 가능으로 분류하며, ClinVar와 높은 일치를 보입니다. 최근에는 산전 진단(예: 초음파 이상 태아의 L1CAM 변이 병원성 신속 판정)에도 활용됩니다.
비코딩(98%) 조절 변이는 AlphaGenome(별도 아이템)이 담당합니다.

적재 현황 (실데이터)

Loaded
적재 변이
4,677,806
missense variants
유전자
314
genes
병원성
2,174,257
불확실
648,826
양성
1,854,723

변이 병원성 검색

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35개 유전자 미스센스 변이 (4,677,806개) 즉시 조회

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IL1A — 5,149개 변이 (점수 높은 순, 44/103p)
변이병원성 확률분류3D
Y15T 0.4891 불확실
E20Y 0.4890 불확실
M127A 0.4889 불확실
F243H 0.4880 불확실
P208G 0.4880 불확실
A75C 0.4876 불확실
D176P 0.4875 불확실
S173H 0.4874 불확실
N121P 0.4869 불확실
N148I 0.4868 불확실
Q50C 0.4867 불확실
D49C 0.4866 불확실
I214F 0.4860 불확실
E69L 0.4859 불확실
G78Q 0.4858 불확실
V80K 0.4856 불확실
F224N 0.4855 불확실
V80Y 0.4855 불확실
V237F 0.4852 불확실
L86T 0.4850 불확실
Y151L 0.4848 불확실
E162Y 0.4843 불확실
Y151D 0.4840 불확실
I109H 0.4838 불확실
C253W 0.4837 불확실
I108P 0.4832 불확실
I100E 0.4832 불확실
A99H 0.4830 불확실
E45Y 0.4827 불확실
A114Y 0.4827 불확실
A156K 0.4827 불확실
G256Y 0.4824 불확실
L97P 0.4824 불확실
I92H 0.4823 불확실
Q248I 0.4820 불확실
G169T 0.4820 불확실
A238E 0.4815 불확실
S120F 0.4814 불확실
Y151I 0.4810 불확실
T153C 0.4809 불확실
L203Y 0.4807 불확실
K172Y 0.4806 불확실
P111N 0.4805 불확실
Q200M 0.4805 불확실
D21M 0.4804 불확실
V72K 0.4797 불확실
K212A 0.4797 불확실
V80Q 0.4797 불확실
N148L 0.4792 불확실
E268P 0.4783 불확실

드라이버 변이 병원성

Variants
유전자변이 AlphaMissense병원성 확률 출처TCGA 빈도3D 구조
BRAF V600E 병원성 가능 0.993 AlphaMissense 실데이터 SKCM 53% 보기
KRAS G12D 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12C 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
NRAS Q61K 병원성 가능 0.985 AlphaMissense 실데이터 SKCM 29% 보기
HRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기
TP53 R175H 병원성 가능 0.986 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
TP53 R248Q 병원성 가능 0.996 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
EGFR L858R 병원성 가능 0.997 AlphaMissense 실데이터 GBM 24% 보기
PIK3CA H1047R 불확실 0.538 AlphaMissense 실데이터 BRCA 34% 보기
IDH1 R132H 병원성 가능 0.992 AlphaMissense 실데이터 GBM 6% 보기
IDH2 R172K 병원성 가능 0.994 AlphaMissense 실데이터 - 보기
KIT D816V 병원성 가능 0.999 AlphaMissense 실데이터 - 보기
CTNNB1 S37F 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기

병원성 확률(0~1)은 실데이터 연동 시에만 표시됩니다. 현재 분류는 임상적으로 확립된 드라이버 기준(예시)이며 AlphaMissense도 동일하게 병원성으로 분류합니다.

산전 진단 연계

Prenatal
AlphaMissense는 초음파 이상 태아에서 발견된 미스센스 변이(예: L1CAM)의 병원성을 신속 판정해 산전 진단 워크플로를 가속한 사례가 보고되었습니다. 양수·융모막 확진검사 · 게놈 산전 종합 리포트와 연계됩니다.

실데이터 연동 방법

Setup
1. AlphaMissense 점수(비상업 연구용)를 받아 우리 유전자 서브셋 TSV로 변환:
gene  protein_variant  am_pathogenicity  am_class (탭 구분)
2. 환경변수 지정: ALPHAMISSENSE_DATA=/path/to/alphamissense_subset.tsv
3. 새로고침하면 위 표의 병원성 확률이 실제 값으로 자동 대체되고 출처가 "AlphaMissense 실데이터"로 표시됩니다.