AlphaMissense 실데이터 연결됨 AlphaGenome API 연결됨 Gemini 연결됨
연동 안내 — 점수를 임의 생성하지 않습니다. 환경변수 ALPHAMISSENSE_DATA(TSV 경로) / ALPHAGENOME_API_KEY를 설정하면 실제 예측값이 자동 표시됩니다. 두 모델은 비상업 연구용 라이선스입니다.

AlphaMissense란

Overview
AlphaFold를 변이 빈도 데이터로 미세조정해 단백질 코딩 미스센스 변이(전체 게놈의 약 2%)의 병원성을 예측하는 모델입니다(Cheng et al., Science 2023). 변이를 양성 가능 / 불확실 / 병원성 가능으로 분류하며, ClinVar와 높은 일치를 보입니다. 최근에는 산전 진단(예: 초음파 이상 태아의 L1CAM 변이 병원성 신속 판정)에도 활용됩니다.
비코딩(98%) 조절 변이는 AlphaGenome(별도 아이템)이 담당합니다.

적재 현황 (실데이터)

Loaded
적재 변이
4,677,806
missense variants
유전자
314
genes
병원성
2,174,257
불확실
648,826
양성
1,854,723

변이 병원성 검색

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35개 유전자 미스센스 변이 (4,677,806개) 즉시 조회

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IL13 — 2,793개 변이 (점수 높은 순, 30/56p)
변이병원성 확률분류3D
L72H 0.4054 불확실
A42H 0.4051 불확실
L28H 0.4046 불확실
K95E 0.4045 불확실
T20F 0.4045 불확실
M76H 0.4042 불확실
F145H 0.4030 불확실
T20G 0.4029 불확실
V37P 0.4029 불확실
P60N 0.4014 불확실
N146A 0.4011 불확실
S83G 0.4009 불확실
F145C 0.4005 불확실
F113E 0.4004 불확실
G30N 0.3999 불확실
E82G 0.3995 불확실
L8D 0.3994 불확실
E48V 0.3981 불확실
F145T 0.3975 불확실
T21C 0.3968 불확실
P60G 0.3967 불확실
L5D 0.3964 불확실
T96M 0.3963 불확실
I85G 0.3962 불확실
T21R 0.3961 불확실
E94I 0.3960 불확실
P38D 0.3953 불확실
Q57H 0.3948 불확실
L10N 0.3947 불확실
P34K 0.3942 불확실
P36M 0.3937 불확실
I53L 0.3929 불확실
N52T 0.3919 불확실
K138Y 0.3917 불확실
I85Y 0.3916 불확실
T20I 0.3916 불확실
L84I 0.3914 불확실
N52Y 0.3914 불확실
S114M 0.3911 불확실
R44A 0.3908 불확실
A59H 0.3898 불확실
R141Y 0.3892 불확실
H135F 0.3891 불확실
E48N 0.3887 불확실
L19P 0.3878 불확실
D131H 0.3869 불확실
L12N 0.3868 불확실
S33M 0.3858 불확실
N56K 0.3856 불확실
E142Y 0.3845 불확실

드라이버 변이 병원성

Variants
유전자변이 AlphaMissense병원성 확률 출처TCGA 빈도3D 구조
BRAF V600E 병원성 가능 0.993 AlphaMissense 실데이터 SKCM 53% 보기
KRAS G12D 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12C 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
NRAS Q61K 병원성 가능 0.985 AlphaMissense 실데이터 SKCM 29% 보기
HRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기
TP53 R175H 병원성 가능 0.986 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
TP53 R248Q 병원성 가능 0.996 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
EGFR L858R 병원성 가능 0.997 AlphaMissense 실데이터 GBM 24% 보기
PIK3CA H1047R 불확실 0.538 AlphaMissense 실데이터 BRCA 34% 보기
IDH1 R132H 병원성 가능 0.992 AlphaMissense 실데이터 GBM 6% 보기
IDH2 R172K 병원성 가능 0.994 AlphaMissense 실데이터 - 보기
KIT D816V 병원성 가능 0.999 AlphaMissense 실데이터 - 보기
CTNNB1 S37F 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기

병원성 확률(0~1)은 실데이터 연동 시에만 표시됩니다. 현재 분류는 임상적으로 확립된 드라이버 기준(예시)이며 AlphaMissense도 동일하게 병원성으로 분류합니다.

산전 진단 연계

Prenatal
AlphaMissense는 초음파 이상 태아에서 발견된 미스센스 변이(예: L1CAM)의 병원성을 신속 판정해 산전 진단 워크플로를 가속한 사례가 보고되었습니다. 양수·융모막 확진검사 · 게놈 산전 종합 리포트와 연계됩니다.

실데이터 연동 방법

Setup
1. AlphaMissense 점수(비상업 연구용)를 받아 우리 유전자 서브셋 TSV로 변환:
gene  protein_variant  am_pathogenicity  am_class (탭 구분)
2. 환경변수 지정: ALPHAMISSENSE_DATA=/path/to/alphamissense_subset.tsv
3. 새로고침하면 위 표의 병원성 확률이 실제 값으로 자동 대체되고 출처가 "AlphaMissense 실데이터"로 표시됩니다.