AlphaMissense 실데이터 연결됨 AlphaGenome API 연결됨 Gemini 연결됨
연동 안내 — 점수를 임의 생성하지 않습니다. 환경변수 ALPHAMISSENSE_DATA(TSV 경로) / ALPHAGENOME_API_KEY를 설정하면 실제 예측값이 자동 표시됩니다. 두 모델은 비상업 연구용 라이선스입니다.

AlphaMissense란

Overview
AlphaFold를 변이 빈도 데이터로 미세조정해 단백질 코딩 미스센스 변이(전체 게놈의 약 2%)의 병원성을 예측하는 모델입니다(Cheng et al., Science 2023). 변이를 양성 가능 / 불확실 / 병원성 가능으로 분류하며, ClinVar와 높은 일치를 보입니다. 최근에는 산전 진단(예: 초음파 이상 태아의 L1CAM 변이 병원성 신속 판정)에도 활용됩니다.
비코딩(98%) 조절 변이는 AlphaGenome(별도 아이템)이 담당합니다.

적재 현황 (실데이터)

Loaded
적재 변이
4,677,806
missense variants
유전자
314
genes
병원성
2,174,257
불확실
648,826
양성
1,854,723

변이 병원성 검색

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35개 유전자 미스센스 변이 (4,677,806개) 즉시 조회

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IL13 — 2,793개 변이 (점수 높은 순, 23/56p)
변이병원성 확률분류3D
P60Y 0.5512 불확실
S88N 0.5512 불확실
L116C 0.5509 불확실
T54R 0.5507 불확실
F31N 0.5507 불확실
L50I 0.5504 불확실
L19H 0.5497 불확실
L25C 0.5496 불확실
R44N 0.5491 불확실
T20K 0.5491 불확실
K137H 0.5490 불확실
K58N 0.5489 불확실
T21E 0.5488 불확실
L43H 0.5485 불확실
F103A 0.5480 불확실
H135P 0.5473 불확실
M99F 0.5473 불확실
N86Q 0.5472 불확실
S83L 0.5466 불확실
H135E 0.5464 불확실
G30Q 0.5460 불확실
R119V 0.5457 불확실
H135C 0.5456 불확실
L17R 0.5451 불확실
H135I 0.5447 불확실
V125M 0.5443 불확실
R119I 0.5429 불확실
L25G 0.5423 불확실
R141A 0.5411 불확실
G29Q 0.5406 불확실
T96S 0.5402 불확실
S83V 0.5394 불확실
E124A 0.5381 불확실
F103L 0.5379 불확실
R98E 0.5372 불확실
C27S 0.5350 불확실
A92F 0.5334 불확실
F103S 0.5327 불확실
L133Y 0.5327 불확실
T26Y 0.5327 불확실
M15P 0.5321 불확실
E82K 0.5319 불확실
A32E 0.5318 불확실
G13M 0.5318 불확실
N63T 0.5316 불확실
T21Y 0.5315 불확실
G143W 0.5315 불확실
K95H 0.5314 불확실
P34D 0.5307 불확실
P34Y 0.5307 불확실

드라이버 변이 병원성

Variants
유전자변이 AlphaMissense병원성 확률 출처TCGA 빈도3D 구조
BRAF V600E 병원성 가능 0.993 AlphaMissense 실데이터 SKCM 53% 보기
KRAS G12D 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12C 병원성 가능 0.998 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
KRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 PAAD 67% 보기
NRAS Q61K 병원성 가능 0.985 AlphaMissense 실데이터 SKCM 29% 보기
HRAS G12V 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기
TP53 R175H 병원성 가능 0.986 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
TP53 R248Q 병원성 가능 0.996 AlphaMissense 실데이터 PAAD 61% 보기
EGFR L858R 병원성 가능 0.997 AlphaMissense 실데이터 GBM 24% 보기
PIK3CA H1047R 불확실 0.538 AlphaMissense 실데이터 BRCA 34% 보기
IDH1 R132H 병원성 가능 0.992 AlphaMissense 실데이터 GBM 6% 보기
IDH2 R172K 병원성 가능 0.994 AlphaMissense 실데이터 - 보기
KIT D816V 병원성 가능 0.999 AlphaMissense 실데이터 - 보기
CTNNB1 S37F 병원성 가능 0.995 AlphaMissense 실데이터 - 보기

병원성 확률(0~1)은 실데이터 연동 시에만 표시됩니다. 현재 분류는 임상적으로 확립된 드라이버 기준(예시)이며 AlphaMissense도 동일하게 병원성으로 분류합니다.

산전 진단 연계

Prenatal
AlphaMissense는 초음파 이상 태아에서 발견된 미스센스 변이(예: L1CAM)의 병원성을 신속 판정해 산전 진단 워크플로를 가속한 사례가 보고되었습니다. 양수·융모막 확진검사 · 게놈 산전 종합 리포트와 연계됩니다.

실데이터 연동 방법

Setup
1. AlphaMissense 점수(비상업 연구용)를 받아 우리 유전자 서브셋 TSV로 변환:
gene  protein_variant  am_pathogenicity  am_class (탭 구분)
2. 환경변수 지정: ALPHAMISSENSE_DATA=/path/to/alphamissense_subset.tsv
3. 새로고침하면 위 표의 병원성 확률이 실제 값으로 자동 대체되고 출처가 "AlphaMissense 실데이터"로 표시됩니다.